Mein aktueller Einstieg in ein R-Script. Es wird unterschieden ob das Script als Entwicklungsscript aus RStudio gestartet wird oder von der Kommandozeile. Je nachdem werden Kommandozeilenparameter unterschiedlich gesetzt oder interpretiert.

    #!/usr/local/bin/Rscript

    args <- commandArgs(F)
    # Checks whether the script was executed from within RStudio or not.
    # In case of RStudio getwd() returns the working directory of the script.
    script.path <- ifelse(args[1] == "RStudio", getwd(), normalizePath(dirname(sub("^--file=", "", args[grep("^--file=", args)]))))

    if(!exists("init___", mode="name")) {source(file.path(script.path, "init.R"))}
    f.init()

    f.configuration <- function() {
        if (args[1] != "RStudio") {
            spec = matrix(c('csv',    'c', 1, "character", "Source CSV data file.",
                            'target', 't', 1, "character", "Target directory to store the analyze."), byrow=TRUE, ncol=5)
            return(getopt(spec))
        }
        return(list(csv = "~/rawdata.csv", target = "~/reports"))
    }

    opt <- f.configuration()